Tác động của cây độc đối với hệ thần kinh khá rõ rệt, đôi khi lấn át các triệu chứng khác. Một số cây kích thích thần kinh. Ngược lại một số cây lại ức chế, làm giảm khả năng phản xạ, thậm chí dẫn tới liệt thần kinh. Ví dụ, atrophin của cây cà độc dược tác động vào hệ giao cảm, gây giãn đồng tử, giãn phế quản, làm tim đập nhanh; strichnin của hạt mã tiền gây kích thích quá ngưỡng các noton thần kinh tủy sống, dẫn tới trạng thái kích thích và co giật toàn thân; aconitin của ô đầu gây kích thích thần kinh ngoại biên; còn morphin của thuốc phiện lúc đầu gây hưng phấn rồi chuyển dần sang ức chế, làm mất cảm giác đau đớn, gây liệt ruột …